Après le crash d'une navette spatiale dans le Gotham City Harbor, Batman et Supermanrencontrent une mystérieuse Kryptonienne aux pouvoirs semblables à ceux de l'homme d'acier. On apprend alors que la kryptonienne est Kara, cousine de Superman, qui la prend sous son aile pour l'éduquer et la familiariser avec la Terre. Cependant, le vilain Darkseid a d'autres plans. Y voyant une opportunité pour enfin vaincre Superman, Darkseid enlève et prend le contrôle de Kara, utilisant la puissante kryptonienne pour faire son travail. C'est à Batman et Supermande sauver Kara, mais ils vont devoir combattre Darkseid sur son monde hostile - là où des menaces mortelles et inconnues se cachent à chaque recoin, et parmi elles une kryptonienne sous contrôle qui peut tenir tête à Superman.